统计学系

宋凯

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  • 发布时间:2018-11-14
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宋凯,男,19878月出生,教授,博士研究生导师,现任统计学系系主任。


主要研究领域是计算生物学与生物信息学。研究方向是针对分子生物学大数据,开发解决具体生物学问题的计算与统计方法。以第一作者或通讯作者发表SCI学术论文20余篇,代表性成果发表在Nature子刊Nature Ecology & EvolutionBriefings in Bioinformatics, PloS Computational Biology等重要学术期刊。主持国家自然科学基金面上项目1项,青年项目1项,山东省自然科学基金面上项目1项。


教育经历:

2005年9月至2009年6月,中国海洋大学,数学科学学院,信息与计算科学专业,获理学学士学位;

2009年9月至2014年6月,北京大学,数学科学学院,概率论与数理统计专业,获理学博士学位。


工作经历:

2014年7月至2018年8月,中国科学院海洋研究所工作,助理研究员;

2018年9月至2019年10月,青岛大学,数学与统计学院,讲师;

2019年11月至2025年12月,青岛大学,数学与统计学院,副教授;

2026年1月至今,青岛大学,数学与统计学院,教授。


主持科研项目情况:

序号

名称

项目来源

本人

位次

执行

期限

进展

情况

1

基于深度学习的微生物群落组学数据融合方法研究

国家自然科学基金面上项目,编号:12571533

主持

2026.01

-2029.12

在研

2

运动促进健康精准监测关键技术和专用芯片的研发

国家重点研发计划“主动健康”专项

子课题负责人

 2022.01

-2023.12

已结题

3

微生物群落多组学数据的整合与建模研究

山东省自然科学基金面上项目,编号:ZR2023MA029

主持

2024.01-2026.12

在研

4

基于宏基因组测序数据的微生物基因组序列鉴定及群落比较方法研究

国家自然科学基金青年项目,编号:11701546

主持

2018.01-2020.12

已结题


学术兼职:

中国生物信息学会,生物信息学算法研究专业委员会委员

中国现场统计研究会贝叶斯统计分会理事


荣誉称号:

2018年9月至2022年8月,青岛大学青年卓越人才;

2024年度青岛大学优秀研究生导师;

2025年度青岛大学优秀研究生导师。


代表性论文:

[1] Xinyu Han and Kai Song. "TphPMF: A microbiome data imputation method using hierarchical Bayesian Probabilistic Matrix Factorization." PLoS Computational Biology 21.3 (2025): e1012858.

[2] Ziwei Sun and Kai Song. "GEMimp: An accurate and robust imputation method for microbiome data using graph embedding neural network." Journal of Molecular Biology 436.23 (2024): 168841.

[3] Qingchun Liu and Kai Song. "ProgCAE: a deep learning-based method that integrates multi-omics data to predict cancer subtypes." Briefings in Bioinformatics 24.4 (2023): bbad196.

[4] Li Li, Ao Li, Kai Song (并列第一作者), et al. "Divergence and plasticity shape adaptive potential of the Pacific oyster." Nature Ecology & Evolution 2.11 (2018): 1751-1760.

[5] Wenjing Chai and Kai Song. "Identification of Non-Coding RNAs Based on Alignment-Free Features in Crassostrea gigas (Pacific Oyster) Transcriptome." Journal of Ocean University of China 21.6 (2022): 1633-1640.

[6] Kai Song. "Genome-wide identification of long non-coding RNAs in Crassostrea gigas and their association with heat stress." Marine Biotechnology 24.4 (2022): 744-752.

[7] Kai Song. "Reads binning improves the assembly of viral genome sequences from metagenomic samples." Frontiers in Microbiology 12 (2021): 664560.

[8] Kai Song. "Classifying the lifestyle of metagenomically-derived phages sequences using alignment-free methods." Frontiers in Microbiology 11 (2020): 567769.

[9] Kai Song, Jie Ren, and Fengzhu Sun. "Reads binning improves alignment-free metagenome comparison." Frontiers in Genetics 10 (2019): 1156.

[10] Kai Song, Shiyong Wen, and Guofan Zhang. "Adaptive evolution patterns in the pacific oyster Crassostrea gigas." Marine Biotechnology 21.5 (2019): 614-622.

[11] Kai Song, Jie Ren, Gesine Reinert, Minghua Deng, Michael S.Waterman, & Fengzhu Sun. (2014). New developments of alignment-free sequence comparison: measures, statistics and next-generation sequencing. Briefings in bioinformatics15(3), 343-353.

[12] Kai Song, Jie Ren, Zhiyuan Zhai, Xuemei Liu, Minghua Deng, & Fengzhu Sun. (2013). Alignment-free sequence comparison based on next-generation sequencing reads. Journal of Computational Biology20(2), 64-79.

[13] Kai Song, Li Li, & Guofan Zhang. (2018). Relationship Among Intron Length, Gene Expression, and Nucleotide Diversity in the Pacific Oyster Crassostrea gigas. Marine Biotechnology20(5), 676-684.

[14] Kai Song, Li Li, & Guofan Zhang. (2017). Bias and correction in RNA-seq data for marine species. Marine Biotechnology19(5), 541-550.

[15] Bai Jiang, Kai Song, Jie Ren, Minghua Deng, Fengzhu Sun, & Xuegong Zhang. (2012). Comparison of metagenomic samples using sequence signatures. BMC Genomics13(1), 730.


联系方式:

办公地点:青岛大学浮山校区励行楼(西七)216室

E-mail:ksong@qdu.edu.cn


   

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